CDR长度/电荷分布

首先进行CDR的识别，识别CDR的方法总体为Kabat方法，重链的CDR1使用的是IMGT方法。然后把抗体的CDR部分抽取出来，然后对抽取出来的CDR的氨基酸个数进行统计，分别计算重链的CDR的氨基酸总个数即为重链CDR的长度，轻链CDR的氨基酸总个数即长度。如果某个CDR的长度过于长，由于CDR大都由loop组成，而过长的loop区则被氧化酶切的风险会相应加大，进而会影响其相应的稳定性，在结果中用红色进行标注。通常治疗性抗体的CDR区带电情况为带正电的与带负电的数量基本相当上下最好不要超过5，这时是处于较平衡的状态。这是因为，如果CDR区的正电荷带的比较多的话（比如超过5个电荷），则此抗体的半衰期可能会比较短，PK表现可能会不好。因为细胞膜的表面是带负电荷的，会吞噬掉CDR表面带正电荷的抗体，从而加快抗体的降解。而如果负电荷的数量远多于正电荷，则会影响抗体的表达量，还会增加抗体的黏度。

结果解读：

如上图所示，通常我们会得到如上图的表格，从左至右每列分别为:

抗体名称Name：

重链的CDR长度HlengthCDR：点击进入链接后会有更详细的结果。

轻链的CDR长度LlengthCDR：

CDR区域所带的正电荷个数PositiveCharge：

CDR区域所带的负电荷个数NegativeCharge：

CDR区域的等电点预测CDRpi：此数值只反映CDR区域的等电点，通常情况下此数值低于4左右会对抗体后期的工艺有所影响，后面人源化后的结果还会给出整个抗体带Fc部分的整体的PI等电点数值。

抗体黏度的预测Viscosity：黏度结果分为High高风险与Low低风险。

抗体表达量的预测Expression：结果分为High、Middle、Low高中低表达量。

点击重链或轻链CDR长度的链接后，会得到下面结果：

结果列表从左至右每列依次为：

Name：抗体名称
Hfulllength：重链的所有CDR长度之和，绿颜色代表长度在已经成药的单抗药物的相应长度的范围内，红颜色则是超出范围。
Lfulllength：轻链的所有CDR长度之和，绿颜色代表长度在已经成药的单抗药物的相应长度的范围内，红颜色则是超出范围。
HCDR1Length：重链的CDR1长度之和，绿颜色代表长度在已经成药的单抗药物的相应长度的范围内，红颜色则是超出范围。
HCDR2Length：重链的CDR2长度之和，绿颜色代表长度在已经成药的单抗药物的相应长度的范围内，红颜色则是超出范围。
HCDR3Length：重链的CDR3长度之和，此外由于通常在不同的抗体中重链的CDR3与轻链的CDR1长度变化比较大，此列重链的CDR3数值与后面一列的轻链的CDR1数值综合考虑，还会考虑此CDR长度在结构上是否会形成比较突出的loop区，因为突出的loop区会对稳定性有一定的影响，因此会用黄颜色标注。目前我们只考虑氨基酸的长度。黄色也是在正常范围内，只是在正常范围内偏长而已。
LCDR1Length：轻链的CDR1长度之和。
LCDR2Length：轻链的CDR2长度之和。
LCDR3Length：轻链的CDR3长度之和。

点击重链或轻链CDR长度的链接后，会得到下面结果：

结果列表从左至右每列依次为：

Name：抗体名称
TotalPosi：整个CDR部分总正电荷数值，绿颜色代表电荷数目在已经成药的单抗药物的相应电荷数目的范围内，红颜色则是超出范围。我们总结了以上市销售的抗体药物的CDR区的电荷特性并做了总结与统计，比如携带正电荷的数量范围1-11。
TotalNegtive：整个CDR部分总负电荷数值，绿颜色代表电荷数目在已经成药的单抗药物的相应电荷数目的范围内，红颜色则是超出范围。上市销售的抗体药物的CDR区的电荷携带负电荷的数量范围1-10。
HposiNum：重链CDR部分总正电荷数值。
HnegNum：重链CDR部分总负电荷数值。
LposiNum：轻链CDR部分总正电荷数值。
LnegNum：轻链CDR部分总负电荷数值。
HCDR1Char：重链CDR1部分带电情况，比如结果RHD/2/1分别代表为此CDR带有电荷的氨基酸为RHD，带有2个正电荷，带有1个负电荷。
HCDR2Char：重链CDR2部分带电情况。
HCDR3Char：重链CDR3部分带电情况。
LCDR1Char：轻链CDR1部分带电情况。
LCDR2Char：轻链CDR2部分带电情况。
LCDR3Char：轻链CDR3部分带电情况。
CDR_PI：整个抗体CDR部分的PI值，此数值只反映CDR区域的等电点，通常情况下此数值低于4左右会对抗体后期的工艺有所影响，会有可能增大抗体的黏度，后面人源化后的结果还会给出整个抗体带Fc部分的整体的PI等电点数值。

通常如果CDR的PI值过于酸性或碱性，而通过后期人源化后整个抗体依然过于酸性或碱性，则此抗体可能会有些潜在的风险，比如过于酸性则可能会引起抗体黏度的增加。过于碱性则抗体的半衰期会缩短。