测序结果分析:测序结果计算整理与分析
通常我们送出测序杂交瘤细胞测序公司返还的是一个压缩文件如sequencing.zip,解压后里面会包含如下的一些文件:
包含的文件是所有的测序结果,其中每一个文件是一个抗体的重链或轻链,里面包含CGCCGGATTCGGAGGTCGAGTTTTTCAG这些未经分析解读的原始的测序结果。接下来进入到我们的测序结果分析栏目:
根据上图界面提示,请输入编辑好的项目名、正反向引物序列、压缩的测序结果文件。
项目名称:需要客户根据自己的实际项目来提供一个编写的项目名称。
输入Primer:输入如图所示的引物序列。
输入PrimerE:输入如图所示的引物序列。
压缩的测序结果文件.zip:输入如**上文中**提到的sequencing.zip,在此输入的一定是.zip结尾的压缩文件。
都输入好后点击提交,静等结果反馈,可以在结果列表里面查看运行状态。当运行结束时会得到如下结果:
结果解读:
如上图所示:>BJ18030502388H3-4PJET1.2-F_J_C11.seq是上面提到的测序结果原始文件的名字,如:
下面的序列就是该文件中测序的原始结果CGCCGGATTCGGAGGTCGAGTTTTTCAG等分析后的抗体氨基酸序列:
QVQLKQSGPGLVAPSQSLSITCTVSGFSLTNYDISWIRQPPGKGLEWLGVIWTGGGTNYNSAFMSRLSISKDKSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCVRGNSYVFAMDYWGQGTSVTVSSAKTTPPSVYPLASL