信号肽预测
根据上图界面提示,请输入需要预测信号肽的一个或多个蛋白序列。
项目名称:需要客户根据自己的实际项目来提供一个编写的项目名称。
输入待计算蛋白序列:输入一个或多个蛋白的序列,具体格式如下:
>first
MRPSGRKSSKMQAFRIWDVNQKTFYLRNNQLVAGYLQGPNVNLEEKIDVVPIEPHALFLGIHGGKMCLSCVKSGDETRLQLEAVNITDLSENRKQDKRFAFIRSDSGPTTSFESAACPGWFLCTAMEADQPVSLTNMPDEGVMVTKFYFQEDE
>second
MRPSGRKSSKMQAFRIWDVNQKTFYLRNNQLVAGYLQGPNVNLEEKIDVVPIEPHALFLGIHGGKMCLSCVKSGDETRLQLEAVNITDLSENRKQDKRFAFIRSDSGPTTSFESAACPGWFLCTAMEADQPVSLTNMPDEGVMVTKFYFQEDE
都输入好后点击提交,静等结果反馈,可以在结果列表里面查看运行状态。当运行结束时会得到如下结果:
结果解读:
如上图所示:标红颜色部分是预测的信号肽区域,绿颜色的G后面则是酶切位点区域。同时下发依次注明了信号肽的类型、预测的可信度、切割位点的位置(29-30位之间、氨基酸VSG与YL之间)、此切割位点的可信度。