抗体人源化改造
我们的程序会提供2个人源化模板方案,第1个是基于序列水平最相似的人源模板,第2个是基于成药、表达量、相似度等选取的人源模板。当这2个模板不太符合客户的需求时、或者客户有自己的人源化的模板来做人源化设计方案时,可以用我们提供的此功能。
如上图所示:
项目名词:给此项目取名。
人源化Fc标签选择:选择最后人源化药物Fc标签,可供选择人的IgG1与IgG4。
输入抗体序列:分别输入某个抗体的重链于轻链序列。序列格式如下:
>Herceptin-1H
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIYPTNGYTRYADSVKGRFTISADTS
>Herceptin-1L
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVNTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSRSGTDFTLTI
每个抗体分为重链与轻链2部分,重链的名称组成为>Herceptin-1H其中>代表此行是抗体名称而不是抗体序列,Herceptin是抗体名称,-1代表是此次输入序列的第1个抗体,在此项任务中我们只写1就可以,H代表是重链。
输入模板的序列:模板序列如上图输入模式所示,从上到下依次输入重链序列与轻链序列,序列名词前用>符合标注。
项目名称、抗体序列及模板序列都输入好后点击提交,静等结果反馈,可以在结果列表里面查看运行状态。会得到如下结果:
结果解读:
此结果解读可以参考上文人源化的结果解读,只是因为是客户自己提供的人源化的模板序列,有些信息是没有的,如:表达量Exrpession、HLmach、Hratio、Lratio、HLfreq几列的数据是不提供的,其它的信息与上文的人源化的结果解读一致。