抗原表位分析

根据上图界面提示,请输入人的抗原序列,以PD1为例,先输入人的PD1序列,然后输入免疫动物的PD1序列,如果免疫动物是小鼠,请输入小鼠的PD1序列。我们抗原表位分析的原理是查找被免疫动物的PD1与免疫抗原PD1在结构上的不同点,以此来分析比较容易形成抗体的表位的大概位置。

项目名称:需要客户根据自己的实际项目来提供一个编写的项目名称。

输入人与被免疫动物的抗原序列:请上面输入人的抗原序列,下面输入被免疫动物新的抗原序列。

抗原的晶体结构:请输入人抗原的晶体结构,以PD1为例,输入人的PD1的晶体结构。如果没有人的PD1晶体结构,可以输入同源性比较高的其它的类似人PD1的晶体结构来进行人的PD1的同源建模。如果需要同源建模,下面请勾选上是。

是否进行3D结构同源建模:根据具体上文的情况来进行勾选。

都输入好后点击提交,静等结果反馈,可以在结果列表里面查看运行状态。当运行结束时会得到如下结果:

结果解读:

如上图所示:结果分为2部分,上面是结构部分,下面是序列比对部分。

上面部分的紫色标准的氨基酸是免疫源性比较强的部分,此位置表位容易形成抗体表位,粉色的次之,绿色的部分则不是免疫源性强的表位。

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