融合蛋白分析：融合蛋白的免疫源性等性质分析

根据上图界面提示，请输入编辑好的项目名称与融合蛋白的序列。

项目名称：需要客户根据自己的实际项目来提供一个编写的项目名称。

输入融合蛋白序列：输入需要计算的一个或多个融合蛋白的序列，具体格式如下：

>Ana
MRPSGRKSSKMQAFRIWDVNQKTFYLRNNQLVAGYLQGPNVNLEEKIDVVPIEPHALFLGIHGGKMCLSCVKSGDETRLQLEAVNITDLSENRKQDKRFAFIRSDSGPTTSFESAACPGWFLCTAMEADQPVSLTNMPDEGVMVTKFYFQEDE

>Hya
MWTGLGPAVTLALVLVVAWATELKPTAPPIFTGRPFVVAWDVPTQDCGPRHKMPLDPKDMKAFDVQASPNEGFVNQNITIFYRDRLGMYPHFNSVGGSVHGGVPQNGSLWVHLEMLKGHVEHYIRTQEPAGLAVIDWEDWRPVWVRNWQDKDVYRRLSRQLVASHHPDWPPERIVKEAQYEFEFAARQFMLETLRFVKAFRPRHLWGFYLFPDCYNHDYVQNWETYTGRCPDVEVSRNDQLSWLWAESTALFPSVYLEETLASSTHGRNFVSFRVQEALRVADVHHANHALPVYVFTRPTYSRGLTGLSEMDLISTIGESAALGAAGVILWGDAGFTTSNETCRRLKDYLTRSLVPYVVNVSWAAQYCSWAQCHGHGRCVRRDPNAHTFLHLSASSFRLVPSHAPDEPRLRPEGELSWADRNHLQTHFRCQCYLGWGGEQCQWDRRRAAGGASGAWAGFHLTGLLAVAVLAFTWTS

其中>代表此行是蛋白的名称而不是序列，Anakinra是蛋白名称序。都输入好后点击提交，静等结果反馈，可以在结果列表里面查看运行状态。当运行结束时会得到如下结果：

结果解读：

如上图所示：结果也可以参看抗体的免疫源性的结果解读。

蛋白名称Name：

与T细胞结合的位点个数Tsites：

与B细胞结合的位点个数Bsites：

点击抗体名称Name或者B细胞结合表位Bsites进入到下图结果：

如上图所示，分别展示了位于第二行的绿颜色的T细胞结合位点与位于第三行的粉红颜色B细胞结合位点。

点击T细胞结合位点数Tsites后进入到下图列表：

如上图所示，结果分为2个部分：

第一部分为预测的人源化后的抗体肽段与人的MHCII可能的结合信息,从左至右每列分别为：

Binding level：结合的强度，分为SB强结合，WB若结合，与空格的微弱结合三个档次。
Binding Affinity(nM)：结合的亲和力
Allele Type：结合人的MHCII的亚型
Allele Frequence：此亚型在亚洲人群的频率
Peptide：结合的抗体肽段，因为是已经人源化的序列，因此肽段通常发生在CDR区域。
Rank：结合的分布，亲和力越高，此数值越小。

第二部分为抗体是否拥有IEDB数据库里实验验证的有免疫源性的肽段，从左至右每列分别为：

Peptides：肽段序列
Allele：结合人的MHCII的亚型
Binding Affinity(nM)：结合的亲和力
Allele Frequence：此亚型在亚洲人群的频率